1、規范系統啟停操作及停運保護措施

系統啟動和停止時，流量和壓力會有波動。過大、過快的流量和壓力波動可能會導致系統發生極限壓降現象，形成水錘作用，從而導致膜元件破裂，故在進行啟停止操作時需緩慢增加或者降低壓力及流量。

2、保持預處理效果的穩定

在預處理階段去除原水中的大部分污染物。良好的預處理效果，能夠有效減少納濾系統受到各類污染的機率。

3、對膜元件進行離線化學清洗

當膜系統經過多次在線化學清洗后無法恢復性能，或者膜系統受到重度污染后，則需要對膜元件進行離線化學清洗。膜元件的重度污染是指污染后的單段壓差大于系統投運初期單段壓差值的2倍以上、反滲透系統產水量下降30%以上或者單支反滲透膜元件質量超過正常數值3kg以上的情況。

4、控制較低的運行壓力和回收率

壓力是納濾脫鹽的推動力，壓力升高，膜組件透水量線性上升，脫鹽率開始時升高，當壓力升至一定值時，脫鹽率趨于平穩。因而在實際運行中，壓力無需太高，壓力過高會使膜的衰減加劇，而且有可能損壞膜組件。為延長膜組件的使用壽命，通常在脫鹽率和產水量滿足生產要求時，采用稍低一些的壓力運行，對系統的長周期運行有著極大的好處。

5、對膜進行物理清洗

沖洗是采用低壓大流量的進水沖洗膜元件，沖洗掉附著在膜表面的污染物和堆積物，膜的低壓沖洗可以減少深度差，防止膜脫水現象的發生。在條件允許的情況下，建議經常對系統進行沖洗。增加沖洗次數比進行一次化學清洗更有效果。

6、定期對膜元件進行在線化學清洗

生物制藥行業用膜采用了合理的預處理系統和良好的運行管理，它只能使膜元件受污染的程度有所降低，要完全消除膜的污染是不可能的。因此，納濾膜系統運行一段時間后，將可能受到多種污染物的污染，尤其是使用在污水深度處理裝置的納濾膜系統，污染更是經常發生一般情況下，經過標準化后的產水量下降15%左右，進水和濃水之間的系統壓降升高到初始值的1.5倍，產水水質有明顯下降，就需要對膜元件進行化學清洗。